RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	INAFM1	C9JVW0	142 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CYC1	P08574	325 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	OR56A5	P0C7T3	313 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CCR7	P32248	378 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CYB561	P49447	251 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	TAS2R50	P59544	299 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	ITIH4	Q14624	930 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	MESD	Q14696	234 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	PACS1	Q6VY07	963 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	SHISA5	Q8N114	240 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	LGI4	Q8N135	537 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	DPH7	Q9BTV6	452 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	GBA3	Q9H227	469 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CBLC	Q9ULV8	474 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A0G2JNJ9	132 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A0U1RQJ8	604 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PPV9	198 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT87P	A6NCN2	255 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CDK2AP1	O14519	115 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	NDC80	O14777	642 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CST8	O60676	142 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	AGTR2	P50052	363 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	PPP2R2B	Q00005	443 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	GXYLT1	Q4G148	440 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	ODF2	Q5BJF6	829 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	SHE	Q5VZ18	495 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	SULF2	Q8IWU5	870 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	P3H4	Q92791	437 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276		Q9UFV3	132 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	ZAN	Q9Y493	2812 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	OR1I1	O60431	355 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	VPS26A	O75436	327 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	GPC4	O75487	556 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	ACVR2A	P27037	513 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	ITGA8	P53708	1063 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	DCAF7	P61962	342 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM53B	Q14153	422 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	TFDP2	Q14188	446 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	IQCB1	Q15051	598 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	SFT2D3	Q587I9	215 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	12.42	□□□□□ -0.42	2e-12	■■■■■ 35
FAM53C-208	ENST00000511276	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	OR51F1	A6NGY5	319 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276		H7C1Q1	480 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	PEX1	O43933	1283 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	GLI4	P10075	376 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	PSMB4	P28070	264 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CMPK1	P30085	196 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	PEX19	P40855	299 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CDKN2B	P42772	138 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	AVPR1B	P47901	424 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	SPARCL1	Q14515	664 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	NAA25	Q14CX7	972 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	KAZN	Q674X7	775 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	TTC23L	Q6PF05	361 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	H2AFV	Q71UI9	128 aa		12.41	□□□□□ -0.42
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42

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