RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504292.1

ABCE1-204, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 3

Gene ABCE1, Length 625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-204	ENST00000504292	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ABCE1-204	ENST00000504292	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ABCE1-204	ENST00000504292	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292		A0A1W2PQM1	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292		K7ERI5	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	TSPAN4	O14817	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	HLA-E	P13747	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	GLRA2	P23416	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	CNTF	P26441	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	HSPA4	P34932	840 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ARL2	P36404	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	NAMPT	P43490	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	FASLG	P48023	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	OSTN	P61366	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	PIGT	Q969N2	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	COL4A2	P08572	1712 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292		A0A087WV48	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	MEI4	A8MW99	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292		E9PAM4	449 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	SH3BP5	O60239	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF217	O75362	1048 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	LDLR	P01130	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	PRB1	P04280	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	APOD	P05090	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ODC1	P11926	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	PAX1	P15863	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	BCKDHB	P21953	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	PAX3	P23760	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	CDA	P32320	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	P2RY2	P41231	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	VEGFC	P49767	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	FOXM1	Q08050	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	GPR17	Q13304	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	TRPC3	Q13507	836 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	FZD8	Q9H461	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	APC2	O95996	2303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	CIT	O14578	2027 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-204	ENST00000504292	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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