RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 OR4L1Q8NH43 312 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SMPDL3BQ92485 455 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RND1Q92730 232 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM10Q96HG1 83 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CNDP1Q96KN2 507 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 OR10A4Q9H209 315 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.26□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.26□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 AHRP35869 848 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 OCRLQ01968 901 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ICE2Q659A1 982 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF534Q76KX8 674 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM73Q86UV7 250 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RASSF1Q9NS23 344 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 LUZP4Q9P127 313 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.26□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 USP27XA6NNY8 438 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PRMT3O60678 531 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CDH16O75309 829 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ERVK-10P10266 1014 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 DRD2P14416 443 aa7.26□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 RBL1P28749 1068 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 OPRM1P35372 400 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PSPHP78330 225 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TMPRSS15P98073 1019 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PCDH1Q08174 1060 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PCID2Q5JVF3 399 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 DET1Q7L5Y6 550 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 BEST3Q8N1M1 668 aa7.26□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 XKR8Q9H6D3 395 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FLNCQ14315 2725 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GTL3 188 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PSMB4P28070 264 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PTGS2P35354 604 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TIMP3P35625 211 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 BCL6P41182 706 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ASCL1P50553 236 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ART1P52961 327 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PNLIPRP1P54315 467 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 MESDQ14696 234 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CNGA4Q8IV77 575 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CABS1Q96KC9 395 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.25□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 PELI2Q9HAT8 420 aa7.25□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.25□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 IST1P53990 364 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 OLIG2Q13516 323 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ODF2Q5BJF6 829 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 HAUS8Q9BT25 410 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ABHD10Q9NUJ1 306 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SPTA1P02549 2419 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.24□□□□□ -1.25
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