RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	MS4A10	Q96PG2	267 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ATF6B	Q99941	703 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	MMP27	Q9H306	513 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	JPT2	Q9H910	190 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	MYNN	Q9NPC7	610 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268		K7ENM7	598 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CCL24	O00175	119 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ATP1B1	P05026	303 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	GJA1	P17302	382 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	STAT2	P52630	851 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MYL7	Q01449	175 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	NTRK2	Q16620	822 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	RNLS	Q5VYX0	342 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PCGF5	Q86SE9	256 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	TEX12	Q9BXU0	123 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PDE7B	Q9NP56	450 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	EQTN	Q9NQ60	294 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		2.58	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	NEMP2	A6NFY4	417 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ENTPD3	O75355	529 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	LDHC	P07864	332 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MAPK12	P53778	367 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	VEZF1	Q14119	521 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	TOMM20	Q15388	145 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	KRT79	Q5XKE5	535 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MRAP	Q8TCY5	172 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SFXN2	Q96NB2	322 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268		Q9H8V8	135 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CHKB	Q9Y259	395 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		2.57	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MYOG	P15173	224 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	NNMT	P40261	264 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	TRIM29	Q14134	588 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PCLAF	Q15004	111 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PHKG1	Q16816	387 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PIK3R3	Q92569	461 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SERAC1	Q96JX3	654 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PSMB7	Q99436	277 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	DPP3	Q9NY33	737 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		2.56	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	KRT33A	O76009	404 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	REN	P00797	406 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	BDNF	P23560	247 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	VAMP7	P51809	220 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	KLC1	Q07866	573 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		2.55	□□□□□ -2
USP34-222	ENST00000498268	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		2.55	□□□□□ -2

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