RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 KIF18AQ8NI77 898 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ATL1Q8WXF7 558 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 PTERQ96BW5 349 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 OR4K3Q96R72 315 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 GPR22Q99680 433 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ING2Q9H160 280 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 NBASA2RRP1 2371 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 FLNCQ14315 2725 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 A6NL46 340 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 MASP2O00187 686 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SLC28A2O43868 658 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 PDGFAP04085 211 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CCDC166P0CW27 439 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 PLA2G2AP14555 144 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 STMN1P16949 149 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CCND1P24385 295 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 HRH2P25021 359 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 BCL6P41182 706 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 RELAQ04206 551 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SSPNQ14714 243 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 GRTP1Q5TC63 336 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD7Q92527 254 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 FKBP10Q96AY3 582 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SPSB2Q99619 263 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 EGFL8Q99944 293 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 HAUS8Q9BT25 410 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 DERL2Q9GZP9 239 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ACSS2Q9NR19 701 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 OARD1Q9Y530 152 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ALBP02768 609 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ANXA5P08758 320 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CD63P08962 238 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CD1DP15813 335 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ECHS1P30084 290 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CCR8P51685 355 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 EMP3P54852 163 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 RAB10P61026 200 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 RAPSNQ13702 412 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CSHL1Q14406 222 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SLMAPQ14BN4 828 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 OR4D1Q15615 310 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 VWA2Q5GFL6 755 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CATSPEREQ5SY80 951 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ZNF740Q8NDX6 193 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 NEIL2Q969S2 332 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 WDR54Q9H977 334 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SLC22A14Q9Y267 594 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 PEX12O00623 359 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 TXNDC9O14530 226 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 FOXS1O43638 330 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 OR1F1O43749 312 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 ACSL3O95573 720 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 SLC35E2BP0CK96 405 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 GRK3P35626 688 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 GDF5P43026 501 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-214ENST00000490425 CDKL1Q00532 357 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms