RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 AGAP11Q8TF27 550 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NCSTNQ92542 709 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RSC1A1Q92681 617 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NEIL2Q969S2 332 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ESAMQ96AP7 390 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MID1IP1Q9NPA3 183 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PSD3Q9NYI0 1048 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PDP2Q9P2J9 529 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 VTI1BQ9UEU0 232 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SNX6Q9UNH7 406 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ASB1Q9Y576 335 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TENM4Q6N022 2769 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SERTM1A2A2V5 107 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KRT87PA6NCN2 255 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 LRRC14BA6NHZ5 514 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CRCPO75575 148 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 DKK1O94907 266 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KRT6AP02538 564 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KRT6BP04259 564 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MSL3P1P0C860 447 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TYRP1P17643 537 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 EPORP19235 508 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CDH3P22223 829 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GRIA3P42263 894 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KRT6CP48668 564 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ACADVLP49748 655 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SH3BP2P78314 561 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PHEXP78562 749 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRAF3Q13114 568 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 DOC2AQ14183 400 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 FBXO48Q5FWF7 155 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PERM1Q5SV97 790 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF425Q6IV72 752 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CUZD1Q86UP6 607 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 FAM129CQ86XR2 697 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 LSMEM2Q8N112 164 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 STON2Q8WXE9 905 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TCTN2Q96GX1 697 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ABCG4Q9H172 646 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ADAM21Q9UKJ8 722 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PPT2Q9UMR5 302 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRAF6Q9Y4K3 522 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRBC2A0A5B9 178 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR2A25A4D2G3 310 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 E7EQ34 232 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 AZIN1O14977 448 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 EDF1O60869 148 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RFPL3O75679 317 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CDH1P12830 882 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 HSD3B1P14060 373 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PCSK2P16519 638 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 HSD3B2P26439 372 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 HMOX2P30519 316 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 LSP1P33241 339 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 AHRP35869 848 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PIK3CBP42338 1070 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CLDN6P56747 220 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ERVPABLB-1P60509 514 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CSNK1G2P78368 415 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CCL7P80098 99 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 REEP5Q00765 189 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MANEAQ5SRI9 462 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 IRGCQ6NXR0 463 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MED27Q6P2C8 311 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 FIGLAQ6QHK4 219 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS11BQ86T26 416 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SYVN1Q86TM6 617 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PAQR7Q86WK9 346 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 LAS2Q8IYD9 372 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF843Q8N446 348 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms