RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SLITRK4Q8IW52 837 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 DEFB124Q8NES8 71 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TRPV3Q8NET8 790 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 METTL6Q8TCB7 284 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SLC41A2Q96JW4 573 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FRG2BQ96QU4 278 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RHBGQ9H310 441 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ELOVL6Q9H5J4 265 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ENAMQ9NRM1 1142 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZNF225Q9UK10 706 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SH2B3Q9UQQ2 575 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RNF11Q9Y3C5 154 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TRAF6Q9Y4K3 522 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 VPS13AQ96RL7 3174 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 DNAH14Q0VDD8 3507 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PPP6CO00743 305 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ITM2AO43736 263 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PRAMEF4O60810 478 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ULK1O75385 1050 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CAPN1P07384 714 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ST6GAL1P15907 406 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 NELFEP18615 380 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TSPAN8P19075 237 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ARRB2P32121 409 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 LSP1P33241 339 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SCTRP47872 440 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 LSSP48449 732 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PPP1CAP62136 330 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CES4AQ5XG92 561 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FCRL6Q6DN72 434 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TRIM73Q86UV7 250 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 D2HGDHQ8N465 521 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZNF781Q8N8C0 355 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CDYL2Q8N8U2 506 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 MFSD9Q8NBP5 474 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 OR8K5Q8NH50 307 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 STON2Q8WXE9 905 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CHMP6Q96FZ7 201 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RTKNQ9BST9 563 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 STRADBQ9C0K7 418 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 BRF2Q9HAW0 419 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FANCEQ9HB96 536 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 NMRK1Q9NWW6 199 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SOHLH2Q9NX45 425 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZFP69BQ9UJL9 534 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PILRAQ9UKJ1 303 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ADAM21Q9UKJ8 722 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ANKDD1BA6NHY2 528 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TRPC5OSA6NMA1 111 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CLEC3AO75596 197 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 VIMP08670 466 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CD22P20273 847 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 VARSP26640 1264 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ARFIP1P53367 373 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 INHBCP55103 352 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 GNGT1P63211 74 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ACY1Q03154 408 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PWP1Q13610 501 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TCTE1Q5JU00 501 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CDCP2Q5VXM1 449 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 LRRC34Q8IZ02 419 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 DNAJC22Q8N4W6 341 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CAMKVQ8NCB2 501 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 OR7G3Q8NG95 312 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 WDR20Q8TBZ3 569 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 USP7Q93009 1102 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 MOCOSQ96EN8 888 aa12.49□□□□□ -0.41
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