RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477087.1

CDKN1B-204, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

TSL 3

Gene CDKN1B, Length 453 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1B-204ENST00000477087 A0A096LPK6 155 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 PRRT4C9JH25 899 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 F8W8V4 182 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 AREL1O15033 823 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 LINC01565O15544 149 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 AP1G1O43747 822 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 PLIN3O60664 434 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TBX10O75333 385 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SRP72O76094 671 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 GOT2P00505 430 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 PYGLP06737 847 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 GRPP07492 148 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TEAD1P28347 426 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SLC8A1P32418 973 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SLC1A2P43004 574 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 EPHB1P54762 984 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 DNAJB13P59910 316 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ATP6V0D1P61421 351 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ASPHQ12797 758 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 CTBP1Q13363 440 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 PEX6Q13608 980 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 HTR4Q13639 388 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.56e-6■■□□□ 13.1
CDKN1B-204ENST00000477087 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 FBXO43Q4G163 708 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TMEM52BQ4KMG9 183 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 CDKL4Q5MAI5 379 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 C9orf64Q5T6V5 341 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 HHATQ5VTY9 493 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 FAM46CQ5VWP2 391 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ATG16L1Q676U5 607 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF470Q6ECI4 717 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 UGT3A1Q6NUS8 523 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 CRTC1Q6UUV9 634 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 DTX2Q86UW9 622 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 C4orf33Q8N1A6 199 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 OR4K2Q8NGD2 314 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ASB12Q8WXK4 309 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ING5Q8WYH8 240 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 DDB2Q92466 427 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 LPGAT1Q92604 370 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 KCNJ9Q92806 393 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 62.8
CDKN1B-204ENST00000477087 ULK4Q96C45 1275 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 EID2BQ96D98 161 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 C7orf26Q96N11 449 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SELENOSQ9BQE4 189 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 GPR63Q9BZJ6 419 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 P2RY12Q9H244 342 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 EBF3Q9H4W6 596 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 FAM96AQ9H5X1 160 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 IL26Q9NPH9 171 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SNX15Q9NRS6 342 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 THAP1Q9NVV9 213 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 COPG2Q9UBF2 871 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 CD207Q9UJ71 328 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 HAO1Q9UJM8 370 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TMCO1Q9UM00 188 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SCML1Q9UN30 329 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF711Q9Y462 761 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 ARL5AQ9Y689 179 aa5.69□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 WIPF3A6NGB9 483 aa5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 CGB1A6NKQ9 187 aa5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 F5H423 210 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 NDUFAB1O14561 156 aa5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 TPP1O14773 563 aa5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 KPNA5O15131 536 aa5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SNX3O60493 162 aa5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 EDF1O60869 148 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CDKN1B-204ENST00000477087 SNNO75324 88 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms