RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 E9PQ18 207 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SOCS2O14508 198 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TBX19O60806 448 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TIPRLO75663 272 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SCELO95171 688 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KCNH1O95259 989 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RASAL1O95294 804 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CEACAM5P06731 702 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RETP07949 1114 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ANXA6P08133 673 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CDH1P12830 882 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 NCK1P16333 377 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GPX2P18283 190 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PRPS1L1P21108 318 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IDSP22304 550 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MAPK1P28482 360 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CTHP32929 405 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3CBP42338 1070 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HALP42357 657 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MTHFRP42898 656 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEA2P43356 314 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HSPA13P48723 471 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MVDP53602 400 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CRYBA2P53672 197 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 POLE2P56282 527 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MYBPC1Q00872 1141 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FOLH1Q04609 750 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PRKCQQ04759 706 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 INPP5AQ14642 412 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PDK3Q15120 406 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ADRM1Q16186 407 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC36Q1X8D7 754 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MPEG1Q2M385 716 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 USP51Q70EK9 711 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MTSS1LQ765P7 747 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 AMZ2Q86W34 360 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PROSER1Q86XN7 944 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PTOV1Q86YD1 416 aa5.44□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.44□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 MICU2Q8IYU8 434 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D21Q8IYX1 336 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FAM86B1Q8N7N1 296 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CLHC1Q8NHS4 586 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HUS1BQ8NHY5 278 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CXorf40AQ8TE69 158 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MIEF2Q96C03 454 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CXorf40BQ96DE9 158 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 APOLD1Q96LR9 279 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LRGUKQ96M69 825 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TSSK3Q96PN8 268 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR52E6Q96RD3 313 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB18Q99592 522 aa5.44□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 LHX9Q9NQ69 397 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf4Q9NR00 106 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DYRK4Q9NR20 520 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA7Q9P0W8 599 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 VPS29Q9UBQ0 182 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CIDEBQ9UHD4 219 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 BTNL2Q9UIR0 455 aa5.44□□□□□ -1.54
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