RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR87Q9BY21 358 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GPAMQ9HCL2 828 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CTSFQ9UBX1 484 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TLK1Q9UKI8 766 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OARD1Q9Y530 152 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB1Q9Y576 335 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RELNP78509 3460 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GX78 115 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2W5A6NFC9 320 aa6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 ARGFXA6NJG6 315 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 C4orf51C9J302 202 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SOCS6O14544 535 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NDC80O14777 642 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RECKO95980 971 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HBQ1P09105 142 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CTAGE8P0CG41 777 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MYBL2P10244 700 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EPORP19235 508 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 AGXTP21549 392 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GCAP28676 217 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OTX2P32243 289 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD17B2P37059 387 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 POU4F1Q01851 419 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HYAL2Q12891 473 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NFATC3Q12968 1075 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNAB2Q13303 367 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SP140Q13342 867 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP1A4Q13733 1029 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CSHL1Q14406 222 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SSPNQ14714 243 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TGFBIQ15582 683 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NKG7Q16617 165 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 VWA2Q5GFL6 755 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TCTE1Q5JU00 501 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MROH9Q5TGP6 573 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ADCK2Q7Z695 626 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RELL1Q8IUW5 271 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 AMER3Q8N944 861 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KCT2Q8NC54 265 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 NXNL1Q96CM4 212 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CATSPER2Q96P56 530 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NDC1Q9BTX1 674 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FUT8Q9BYC5 575 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 DERL2Q9GZP9 239 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 NFU1Q9UMS0 254 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX7Q9UNH6 387 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 POLHQ9Y253 713 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF839A8K0R7 811 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 JRKO75564 520 aa6.66□□□□□ -1.34
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