RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 ACAT2Q9BWD1 397 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 RHBGQ9H310 441 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM9Q9P0T7 183 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL3Q9UH77 587 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 DYRK1BQ9Y463 629 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 UNC13CQ8NB66 2214 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBC2A0A5B9 178 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ISM1B1AKI9 464 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 H3BMH7 237 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CTSVO60911 334 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ST6GAL1P15907 406 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TSPAN8P19075 237 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CCKBRP32239 447 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 LSP1P33241 339 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 GCGRP47871 477 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SCTRP47872 440 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CCNG1P51959 295 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 GYS2P54840 703 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 IRF8Q02556 426 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF33BQ06732 778 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CHIT1Q13231 466 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 XKR7Q5GH72 579 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CGB2Q6NT52 195 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 USP53Q70EK8 1073 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 MAVSQ7Z434 540 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 VN1R4Q7Z5H5 301 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 HOMEZQ8IX15 550 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TGM7Q96PF1 710 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CDK15Q96Q40 435 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 MAP3K3Q99759 626 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CMKLR1Q99788 373 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 DPH7Q9BTV6 452 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ACTR8Q9H981 624 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SNX7Q9UNH6 387 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PCM1Q15154 2024 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM233B4DJY2 109 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 H7BY64 318 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 HAT1O14929 419 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CLGNO14967 610 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 AZIN1O14977 448 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4F21O95013 312 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TGDSO95455 350 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 HSPA4LO95757 839 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CAPN1P07384 714 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ADRB1P08588 477 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 UROSP10746 265 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PVRP15151 417 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CDH3P22223 829 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SERPINB1P30740 379 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 AHRP35869 848 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 BCL6P41182 706 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 HTR6P50406 440 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 HK2P52789 917 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 LAPTM5Q13571 262 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ISXQ2M1V0 245 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TUBB8Q3ZCM7 444 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 XKR6Q5GH73 641 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms