RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 ITPAQ9BY32 194 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TLR4O00206 839 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DNAJB5O75953 348 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 POU2F1P14859 743 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PHC1P78364 1004 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FRG2Q64ET8 278 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FRG2BQ96QU4 278 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 WDR26Q9H7D7 661 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CNTN3Q9P232 1028 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PRELID1Q9Y255 219 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 E2F3O00716 465 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 IRF6O14896 467 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 KLRC4O43908 158 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RAD51DO75771 328 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 IFNA4P05014 189 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CSN2P05814 226 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF30P17039 623 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 IMPDH1P20839 514 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CTBP2P56545 445 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PER3P56645 1201 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GPR68Q15743 365 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 EOGTQ5NDL2 527 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ELP5Q8TE02 316 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 THEM6Q8WUY1 208 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CPT1BQ92523 772 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SMARCD2Q92925 531 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GPR20Q99678 358 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FUZQ9BT04 418 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZFP57Q9NU63 452 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 IQCF5A8MTL0 148 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 AHSA1O95433 338 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF35P13682 527 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GLDCP23378 1020 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 S100A10P60903 97 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NFE2L1Q14494 772 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ACTL8Q9H568 366 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TISP43B9A030 160 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF45Q02386 682 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GBE1Q04446 702 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PTGR1Q14914 329 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GRIK5Q16478 980 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LGI4Q8N135 537 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 POC1BQ8TC44 478 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR5B12Q96R08 314 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FZD10Q9ULW2 581 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PADI3Q9ULW8 664 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SYNGR4O95473 234 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ADH6P28332 368 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NMBRP28336 390 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC18A1P54219 525 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LILRA4P59901 499 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms