RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 OAZ3Q9UMX2 235 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 GLUD1P00367 558 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 FGF1P05230 155 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ERVK-8P63133 956 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 FGL1Q08830 312 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 LCP2Q13094 533 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 NODALQ96S42 347 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 SYT11Q9BT88 431 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CACNG4Q9UBN1 327 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0U1RQK1 487 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF320A2RRD8 509 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 A6NLC8 198 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 SERPINA3P01011 423 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 STATHP02808 62 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 RYKP34925 604 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CTSKP43235 329 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CLCQ05315 142 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 PQLC3Q8N755 202 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 FZD8Q9H461 694 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 APODP05090 189 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 UGT1A6P19224 532 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 UGT1A1P22309 533 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 UGT1A4P22310 534 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 UGT1A3P35503 534 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 DNASE1L1P49184 302 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 C2orf80Q0P641 193 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 OR5T3Q8NGG3 340 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 C12orf66Q96MD2 445 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 HBEGFQ99075 208 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 PDE10AQ9Y233 779 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ANGPTL1O95841 491 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CD2P06729 351 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CALCBP10092 127 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 IDUAP35475 653 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 RHDQ02161 417 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CHSY3Q70JA7 882 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.3□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 QSOX1O00391 747 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 BCKDKO14874 412 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 DLX3O60479 287 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 LMO2P25791 158 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 SNAPC1Q16533 368 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 OGFOD2Q6N063 350 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ANKRD46Q86W74 232 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ADAMTS15Q8TE58 950 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 C3orf49Q96BT1 292 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CREBZFQ9NS37 354 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 AQP12BA6NM10 295 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 GRM6O15303 877 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 IFNA6P05013 189 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 GPR135Q8IZ08 494 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CPA6Q8N4T0 437 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ZBTB2Q8N680 514 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 OR4K2Q8NGD2 314 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 HUS1BQ8NHY5 278 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 CD320Q9NPF0 282 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 IFNGP01579 166 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 RBFAQ8N0V3 343 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 TBX5Q99593 518 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 SLC22A4Q9H015 551 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 BTBD17A6NE02 478 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 H3BNH8 94 aa11.29□□□□□ -0.6
CCBE1-202ENST00000439986 VIPP01282 170 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms