RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IRX4P78413 519 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RUNX1T1Q06455 604 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIF19Q2TAC6 998 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C12orf60Q5U649 245 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM166AQ6J272 317 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BTNL8Q6UX41 500 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GFRALQ6UXV0 394 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 B3GLCTQ6Y288 498 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARMC9Q7Z3E5 817 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SERPINA12Q8IW75 414 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF114Q8NC26 417 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LEMD2Q8NC56 503 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C14orf79Q96F83 325 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINGO1Q96FE5 620 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RASL10BQ96S79 203 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATG10Q9H0Y0 220 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 P2RY12Q9H244 342 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSPY26PQ9H489 355 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FGF21Q9NSA1 209 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIF3AQ9Y496 699 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAGEB16A2A368 324 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C2orf81A6NN90 581 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAGEB2O15479 319 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TEX28O15482 410 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GRAP2O75791 330 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PIGNO95427 931 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BAG3O95817 575 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MT-ATP6P00846 226 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HEXBP07686 556 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM200BP0CF97 657 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ETS1P14921 441 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 JAK1P23458 1154 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SFNP31947 248 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SFTPDP35247 375 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HERV-K104P61576 105 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TUBA1BP68363 451 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC3A1Q07837 685 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC20A2Q08357 652 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DLG1Q12959 904 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDE7AQ13946 482 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM171BQ6P995 826 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GSG1LQ6UXU4 331 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CUZD1Q86UP6 607 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM219Q86XT9 240 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AQP12AQ8IXF9 295 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDK20Q8IZL9 346 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NR4A3Q92570 626 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSGA13Q96PP4 275 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNF121Q9H920 327 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AURKCQ9UQB9 309 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A087X0K7 114 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PPI3 338 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C5orf51A6NDU8 294 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CFAP73A6NFT4 308 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ERVV-2B6SEH9 535 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GHRP10912 638 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACP2P11117 423 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NR1D1P20393 614 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAGEB1P43366 347 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NR2C2P49116 596 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GAS1P54826 345 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DSCR9P59020 149 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SSTP61278 116 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GALK2Q01415 458 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BNC1Q01954 994 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms