RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 HID1Q8IV36 788 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 OR2A1Q8NGT9 310 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 CHTF18Q8WVB6 975 aa20.17■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.16■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.16■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.16■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 SLC6A18Q96N87 628 aa20.16■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 CMTM6Q9NX76 183 aa20.16■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PPT2Q9UMR5 302 aa20.16■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 PIK3CBP42338 1070 aa20.15■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 KRT33BQ14525 404 aa20.15■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 ZBTB18Q99592 522 aa20.15■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.15■□□□□ 0.82
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GPC1-202ENST00000420138 SLC19A1P41440 591 aa20.14■□□□□ 0.81
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GPC1-202ENST00000420138 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.14■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.14■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.14■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.14■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD53Q8N9V6 530 aa20.14■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.14■□□□□ 0.81
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GPC1-202ENST00000420138 TRIM8Q9BZR9 551 aa20.14■□□□□ 0.81
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GPC1-202ENST00000420138 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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GPC1-202ENST00000420138 PCSK2P16519 638 aa20.13■□□□□ 0.81
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GPC1-202ENST00000420138 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.13■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.13■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.13■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 SNX19Q92543 992 aa20.13■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 GTF2H4Q92759 462 aa20.13■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.13■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 TESCQ96BS2 214 aa20.13■□□□□ 0.81
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