RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 CD93Q9NPY3 652 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ADA2Q9NZK5 511 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 PRR19A6NJB7 356 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 H0Y8X5 98 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM38O00635 465 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 FBP2O00757 339 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 RASGRP1O95267 797 aa6.39□□□□□ -1.39
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HDAC8-211ENST00000415409 IL6P05231 212 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 IGHV4-34P06331 123 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ERGP11308 486 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 BCKDHAP12694 445 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CDH1P12830 882 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CD1EP15812 388 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CD22P20273 847 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CAPN3P20807 821 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ADH6P28332 368 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 PKLRP30613 574 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 SERPINB1P30740 379 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ACTR1BP42025 376 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 PIK3CBP42338 1070 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 RAB28P51157 221 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CCR8P51685 355 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ACTR3P61158 418 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ACTR1AP61163 376 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ABATP80404 500 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TFF2Q03403 129 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ZP2Q05996 745 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 E2F2Q14209 437 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CLCA4Q14CN2 919 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 RPE65Q16518 533 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 SPATS1Q496A3 300 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 SPIN4Q56A73 249 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 XP32Q5T750 250 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 HPS6Q86YV9 775 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 HID1Q8IV36 788 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 LAS2Q8IYD9 372 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 OR13H1Q8NG92 308 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 SNX19Q92543 992 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 JADE3Q92613 823 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 BIRC7Q96CA5 298 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.39□□□□□ -1.39
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HDAC8-211ENST00000415409 APOLD1Q96LR9 279 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 YY1AP1Q9H869 796 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 TAC3Q9UHF0 121 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-211ENST00000415409 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.39□□□□□ -1.39
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