RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TCEANCQ8N8B7 351 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 AVL9Q8NBF6 648 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR4K1Q8NGD4 311 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR4D10Q8NGI6 311 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PIK3R3Q92569 461 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NABP1Q96AH0 204 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF799Q96GE5 643 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PGAM5Q96HS1 289 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TBATAQ96M53 351 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RANBP9Q96S59 729 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CDRT15Q96T59 188 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 EBF4Q9BQW3 602 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PI4K2AQ9BTU6 479 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ITPAQ9BY32 194 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHMP4AQ9BY43 222 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZMYND12Q9H0C1 365 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CLEC4EQ9ULY5 219 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF148Q9UQR1 794 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 WDR83OSQ9Y284 106 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PADI2Q9Y2J8 665 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NME7Q9Y5B8 376 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NEDD4P46934 1319 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGSF1Q8N6C5 1336 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MTMR11A4FU01 709 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NEMP2A6NFY4 417 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RSPH10B2B2RC85 870 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 F8VVB4 439 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 F8VWA3 439 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CREB3O43889 395 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRT33AO76009 404 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TOMM70O94826 608 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 BAG3O95817 575 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RSPH10BP0C881 870 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ADORA3P0DMS8 318 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 AADACP22760 399 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PAX3P23760 479 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 GARSP41250 739 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RGRP47804 291 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 VAMP7P51809 220 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MFAP4P55083 255 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CDH13P55290 713 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 BTG1P62324 171 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SRPXP78539 464 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 KLC1Q07866 573 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRT32Q14532 448 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 IRF3Q14653 427 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CRYMQ14894 314 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PHKG1Q16816 387 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 UPP1Q16831 310 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF506Q5JVG8 444 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR4A47Q6IF82 309 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMUB2Q71RG4 321 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC24A5Q71RS6 500 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 Q7L0L9 218 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF595Q8IYB9 648 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 GPC2Q8N158 579 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR6T1Q8NGN1 323 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF721Q8TF20 911 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 RNF138Q8WVD3 245 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 UCMAQ8WVF2 138 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 METTL21AQ8WXB1 218 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 USP6NLQ92738 828 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SPDL1Q96EA4 605 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CFAP57Q96MR6 1250 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SFXN2Q96NB2 322 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 KLHL5Q96PQ7 755 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 NEDD4LQ96PU5 975 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 CTRCQ99895 268 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SCRT1Q9BWW7 348 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC26A6Q9BXS9 759 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 HES7Q9BYE0 225 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 DEFB126Q9BYW3 111 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MTMR12Q9C0I1 747 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MUC13Q9H3R2 512 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-177P-201ENST00000411257 MYH16Q9H6N6 1097 aa0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms