RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ARFRP1Q13795 201 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SYT16Q17RD7 645 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 KIAA1191Q96A73 305 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 NPY6RQ99463 290 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 JUNP05412 331 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 OGDHQ02218 1023 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ABHD18Q0P651 414 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 MS4A13Q5J8X5 152 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 TMEM164Q5U3C3 297 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 C22orf39Q6P5X5 142 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 AGTRAPQ6RW13 159 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 C6orf89Q6UWU4 347 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PREBQ9HCU5 417 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 GMEB1Q9Y692 573 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 M0R2N6 131 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PDLIM1O00151 329 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 KAT7O95251 611 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CCDC115Q96NT0 180 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SMOQ99835 787 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 BTBD1Q9H0C5 482 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ACTR3BQ9P1U1 418 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 A0A1W2PP18 115 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 INCA1Q0VD86 236 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CEACAM20Q6UY09 585 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CLDND1Q9NY35 253 aa18■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CPED1A4D0V7 1026 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SCDO00767 359 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 MMP20O60882 483 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PLGP00747 810 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SLC18A2Q05940 514 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ST3GAL3Q11203 375 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ZNF234Q14588 700 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SLC39A4Q6P5W5 647 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 OR56A1Q8NGH5 318 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PMM1Q92871 262 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SDHAF3Q9NRP4 125 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ZNF224Q9NZL3 707 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PCP4L1A6NKN8 68 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CAPN14A8MX76 684 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ATF6P18850 670 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 FBXO43Q4G163 708 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ZNF615Q8N8J6 731 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 B3GNT4Q9C0J1 378 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 TMEM248Q9NWD8 314 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 BAIAP2Q9UQB8 552 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PRH1P02810 166 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 F7P08709 466 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PSKH1P11801 424 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 NR2C1P13056 603 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 FPR1P21462 350 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ARPC4P59998 168 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 UFM1P61960 85 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ALG1LQ6GMV1 187 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 TMEM17Q86X19 198 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 MARCH9Q86YJ5 346 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CILP2Q8IUL8 1156 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ZNF461Q8TAF7 563 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 UCK2Q9BZX2 261 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 RNF121Q9H920 327 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 TPT1P8Q9HAU6 139 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 WNT6Q9Y6F9 365 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PGAM2P15259 253 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 GDF5P43026 501 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 EPGNQ6UW88 154 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ZNF627Q7L945 461 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SLC5A11Q8WWX8 675 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ACOT12Q8WYK0 555 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 NCSTNQ92542 709 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 NDC1Q9BTX1 674 aa17.99■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 FAM170BA6NMN3 283 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PRAMEF11O60813 436 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 AOC1P19801 751 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SLC11A1P49279 550 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CEBPGP53567 150 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 OR12D2P58182 307 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ABCA11PQ4W5N1 156 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 TIFABQ6ZNK6 161 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 C17orf50Q8WW18 174 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 SLC22A4Q9H015 551 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 ADAMTS3O15072 1205 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 PCDHGA12O60330 932 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 TYRP14679 529 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 AMIGO1Q86WK6 493 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 NFKBIDQ8NI38 313 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 CCDC107Q8WV48 283 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 MAGEE1Q9HCI5 957 aa17.98■□□□□ 0.47
USP25-204ENST00000400183 C3P01024 1663 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms