RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 TPRKBQ9Y3C4 175 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 MITFO75030 526 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 ANGPTL1O95841 491 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 LAMP1P11279 417 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 PCMT1P22061 227 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 HPCAL1P37235 193 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 Q6ZNX1 250 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 CEP68Q76N32 757 aa22.31■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 GLYATL1Q969I3 302 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 MED8Q96G25 268 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 APOL4Q9BPW4 351 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 RIBC2Q9H4K1 309 aa22.31■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 CLTBP09497 229 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 JUNDP17535 347 aa22.31■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 CLECL1Q8IZS7 167 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 FKBP10Q96AY3 582 aa22.31■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 FUNDC2Q9BWH2 189 aa22.31■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 MAPK10P53779 464 aa22.3■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 C21orf59P57076 290 aa22.3■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.3■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 OR4K3Q96R72 315 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 CSF3RQ99062 836 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 ENPP5Q9UJA9 477 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 TTC34A8MYJ7 566 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 PTGES3LE9PB15 166 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.29■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 hCG_2039718K7EN88 272 aa22.29■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 CNIH3Q8TBE1 160 aa22.29■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.29■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 IMPA1P29218 277 aa22.28■■□□□ 1.16
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RABGGTA-202ENST00000399409 PREPP48147 710 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 VLDLRP98155 873 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 OR7G3Q8NG95 312 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-202ENST00000399409 OTUB2Q96DC9 234 aa22.28■■□□□ 1.16
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