RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 MVB12AQ96EY5 273 aa9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TAAR6Q96RI8 345 aa9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 KIFC1Q9BW19 673 aa9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 COPG2Q9UBF2 871 aa9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SOX13Q9UN79 622 aa9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 LRRK2Q5S007 2527 aa9.82□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SEC16AO15027 2179 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF839A8K0R7 811 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PCDH17O14917 1159 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 HAT1O14929 419 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 P2RX6O15547 441 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PHF2O75151 1096 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 RASAL1O95294 804 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 WDPCPO95876 746 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PRF1P14222 555 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PAMP19021 973 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TPSB2P20231 275 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 OGNP20774 298 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SLC26A3P40879 764 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 VPS41P49754 854 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CUL1Q13616 776 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PCOLCEQ15113 449 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TPSAB1Q15661 275 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 INAQ16352 499 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 GARNL3Q5VVW2 1013 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF425Q6IV72 752 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CASC4Q6P4E1 433 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CENPUQ71F23 418 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 HAS2Q92819 552 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 POM121Q96HA1 1249 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 OR2A5Q96R48 311 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TCF12Q99081 682 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SLC30A3Q99726 388 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 DRC3Q9H069 523 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.81□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CACNA1DQ01668 2161 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1W2PQ72 361 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CTAGE9A4FU28 777 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 AVILO75366 819 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 UNC5CO95185 931 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SLC16A8O95907 504 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 FGGP02679 453 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 HSD17B2P37059 387 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 AVPR1BP47901 424 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 EFNA3P52797 238 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ADARP55265 1226 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF33BQ06732 778 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 NDUFA9Q16795 377 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 OR9A4Q8NGU2 314 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF480Q8WV37 535 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 METTL21AQ8WXB1 218 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 RELTQ969Z4 430 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TGIF2Q9GZN2 237 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.8□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 OR5H15A6NDH6 313 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 A8MUI8 341 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 E7ENX8 843 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 H7BY64 318 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CCL21O00585 134 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TXNDC9O14530 226 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PRAMEF2O60811 474 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms