RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364472.1

RNU4-38P-201, Transcript of RNA, U4 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU4-38P, Length 129 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU4-38P-201ENST00000364472 HSD3B2P26439 372 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 VARSP26640 1264 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 GSTM2P28161 218 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SERPINB3P29508 390 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ALDH4A1P30038 563 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CMPK1P30085 196 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 HMOX2P30519 316 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SERPINB1P30740 379 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 LSP1P33241 339 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 AHRP35869 848 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 HSD17B2P37059 387 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 PLA2G5P39877 138 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 BCL6P41182 706 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 HNF4AP41235 474 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 GRIA3P42263 894 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 PIK3CBP42338 1070 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CASP2P42575 452 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SCTRP47872 440 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLC1A6P48664 564 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 KRT6CP48668 564 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 PIK3CGP48736 1102 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 IDH3AP50213 366 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 HTR6P50406 440 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 RPL14P50914 215 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ATP1A2P50993 1020 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CCR8P51685 355 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CCNG1P51959 295 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 HK2P52789 917 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ARFIP1P53367 373 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 NAGLUP54802 743 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 GYS2P54840 703 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 EMP3P54852 163 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 FOXA1P55317 472 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 PKNOX1P55347 436 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CLDN6P56747 220 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 OR1D5P58170 312 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ERVPABLB-1P60509 514 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 RPS13P62277 151 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SH3BP2P78314 561 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 RAE1P78406 368 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CCL7P80098 99 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ABATP80404 500 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 DAB2P98082 770 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 E2F1Q01094 437 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 IRF8Q02556 426 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 BTKQ06187 659 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CYP4F3Q08477 520 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ASPHQ12797 758 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 HYAL2Q12891 473 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CDC16Q13042 620 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 PRKAA1Q13131 559 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CHIT1Q13231 466 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 STX3Q13277 289 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 BIRC2Q13490 618 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 TUBB3Q13509 450 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 LAPTM5Q13571 262 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 PWP1Q13610 501 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CUL3Q13618 768 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 FAM53BQ14153 422 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SPIDRQ14159 915 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 DOC2AQ14183 400 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 KRT33BQ14525 404 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 NAA25Q14CX7 972 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 C16orf72Q14CZ0 275 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 KIAA0040Q15053 153 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SF1Q15637 639 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ISXQ2M1V0 245 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 MUM1Q2TAK8 710 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 SMU1Q2TAY7 513 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 PRTGQ2VWP7 1150 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 DEFB110Q30KQ9 67 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ADPRMQ3LIE5 342 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 TUBB8Q3ZCM7 444 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 XKR7Q5GH72 579 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 XKR6Q5GH73 641 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 PAGE2BQ5JRK9 111 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 CFAP157Q5JU67 520 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU4-38P-201ENST00000364472 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms