RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 NCSTNQ92542 709 aa15.86■□□□□ 0.13
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.136e-7■□□□□ 11.1
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SH3BP4-201ENST00000344528 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.84■□□□□ 0.13
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SH3BP4-201ENST00000344528 M0QX08 132 aa15.84■□□□□ 0.13
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SH3BP4-201ENST00000344528 NOBOXO60393 691 aa15.84■□□□□ 0.13
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SH3BP4-201ENST00000344528 TYROBPO43914 113 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 TM4SF4P48230 202 aa15.84■□□□□ 0.13
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SH3BP4-201ENST00000344528 MS4A12Q9NXJ0 267 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf74A8MZ97 194 aa15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 S1PR4O95977 384 aa15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 DHFRP00374 187 aa15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 TYRP1P17643 537 aa15.83■□□□□ 0.13
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SH3BP4-201ENST00000344528 XKP51811 444 aa15.83■□□□□ 0.13
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