RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309836.9

SPIRE1-201, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPIRE1, Length 1,877 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-201ENST00000309836 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 GIPC3Q8TF64 312 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 MED8Q96G25 268 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 MTG2Q9H4K7 406 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TSPAN11A1L157 253 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TTC34A8MYJ7 566 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 H0YIV9 168 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 J3QRK9 145 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 NPC1O15118 1278 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 NDUFS2O75306 463 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 SH3BGRLO75368 114 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 FGF18O76093 207 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CTSLP07711 333 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 NUDT7P0C024 238 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 JUNDP17535 347 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 MAP2K4P45985 399 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CRYBA2P53672 197 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 IL1RL1Q01638 556 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 KEAP1Q14145 624 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CTF1Q16619 201 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 ARSIQ5FYB1 569 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 SETD9Q8NE22 299 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 IRF7Q92985 503 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TOX2Q96NM4 488 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 PKP4Q99569 1192 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 DUSP26Q9BV47 211 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 SGK2Q9HBY8 427 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 C1orf226A1L170 272 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 GABRR3A8MPY1 467 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 MAN1A2O60476 641 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 MOSPD3O75425 235 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 DNAJB5O75953 348 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TYRP14679 529 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 EPHA2P29317 976 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 PPM1AP35813 382 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 MASP1P48740 699 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 ITGA1P56199 1179 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 PCDH1Q08174 1060 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 GAB1Q13480 694 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 ACOX1Q15067 660 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 SYTL3Q4VX76 610 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 HORMAD1Q86X24 394 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 OR56A3Q8NH54 315 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 GLMNQ92990 594 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 DUSP21Q9H596 190 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TRIM17Q9Y577 477 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 E9PQ18 207 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 JRKO75564 520 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 CXCL14O95715 111 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 HSD3B1P14060 373 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 IDSP22304 550 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 HSD3B2P26439 372 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 ACVR2AP27037 513 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 IMPA1P29218 277 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 HNF4AP41235 474 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 SLC35A2P78381 396 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 TEAD2Q15562 447 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 HKDC1Q2TB90 917 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 FAHD1Q6P587 224 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIRE1-201ENST00000309836 DPPA4Q7L190 304 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms