RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 DBN1Q16643 649 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 KAZNQ674X7 775 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM222BQ8WU58 562 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NRGNQ92686 78 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.226e-6■■■■□ 23.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 APOL2Q9BQE5 337 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CARD6Q9BX69 1037 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 HCFC1P51610 2035 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2A25A4D2G3 310 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMD3O43242 534 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NEURL1O76050 574 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINC1P01008 464 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 C8BP07358 591 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TPBGLP0DKB5 382 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TNNT1P13805 278 aa7.41□□□□□ -1.22
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PGGT1B-201ENST00000296642 HSD17B2P37059 387 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CETN2P41208 172 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBED6P86452 979 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 RELAQ04206 551 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NSDHLQ15738 373 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM198Q66K66 360 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ADCK2Q7Z695 626 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC20BQ86Y33 519 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 P3H2Q8IVL5 708 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 AMER3Q8N944 861 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SMPDL3AQ92484 453 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf90Q96M02 699 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 IL17FQ96PD4 163 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 DPH7Q9BTV6 452 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 BDH2Q9BUT1 245 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 HES7Q9BYE0 225 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF358Q9NW07 568 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TACC2O95359 2948 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0U1RQJ8 604 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NNC1 897 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PFDN6O15212 129 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PSTPIP1O43586 416 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 HS6ST1O60243 411 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR1O75083 606 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM253P0C7T8 217 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCRC1P31930 480 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ADRA1AP35348 466 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 XCR1P46094 333 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 HLCSP50747 726 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP107P57740 925 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4D2P58180 307 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ABATP80404 500 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PLGLB1Q02325 96 aa7.4□□□□□ -1.22
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