RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 TUBA1BP68363 451 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 AGAP6Q5VW22 663 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 TUBA1AQ71U36 451 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 AGAP4Q96P64 663 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF221Q9UK13 617 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRTM1-201ENST00000295057 OR1I1O60431 355 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 DIRAS1O95057 198 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 KRT6AP02538 564 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 KRT6BP04259 564 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 GADD45AP24522 165 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 GRK5P34947 590 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CREMQ03060 361 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 NR6A1Q15406 480 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ING5Q8WYH8 240 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 SNX6Q9UNH7 406 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 LINC01553A4QN01 128 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CLDN24A6NM45 220 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 EVPLLA8MZ36 301 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 HAT1O14929 419 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CREG1O75629 220 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 MLYCDO95822 493 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CAPN1P07384 714 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 FADDQ13158 208 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 KIAA0040Q15053 153 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CPZQ66K79 652 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 SETD9Q8NE22 299 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 GTF2H4Q92759 462 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 DERL2Q9GZP9 239 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CERS4Q9HA82 394 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 E2F3O00716 465 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 MVKQ03426 396 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 GTF2H3Q13889 308 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 PNCKQ6P2M8 343 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 AADATQ8N5Z0 425 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 GPR21Q99679 349 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 A0A096LPI6 279 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 M0R082 166 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 LATS1O95835 1130 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 RHOP08100 348 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 HLA-FP30511 346 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CA5AP35218 305 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 METTL6Q8TCB7 284 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC38A4Q969I6 547 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 ITPAQ9BY32 194 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CLPBQ9H078 707 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 MAFFQ9ULX9 164 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.81□□□□□ -0.04
LRRTM1-201ENST00000295057 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms