RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 GABARAPO95166 117 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SERPINA4P29622 427 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SEMG2Q02383 582 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CREMQ03060 361 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 VGLL4Q14135 290 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 LBX2Q6XYB7 198 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PCYT2Q99447 389 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MND1Q9BWT6 205 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 NUP50Q9UKX7 468 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 KMOO15229 486 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SEPT4O43236 478 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TBX18O95935 607 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 FGF4P08620 206 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TNFSF8P32971 234 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TAF10Q12962 218 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CLCA1A8K7I4 914 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 M0R129 80 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CAPNS1P04632 268 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 HTR7P34969 479 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CLCN4P51793 760 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TAS2R41P59536 307 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SCARB2Q14108 478 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SMOQ99835 787 aa14.65□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 IRGMA1A4Y4 181 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 OR1I1O60431 355 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 IGSF6O95976 241 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ACVRL1P37023 503 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ADAM15Q13444 863 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 SELPLGQ14242 412 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ZMYND11Q15326 602 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 CCDC157Q569K6 752 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ZNF691Q5VV52 312 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ASB15Q8WXK1 588 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 TBX5Q99593 518 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ADAM2Q99965 735 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 TRBC2A0A5B9 178 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 HMX3A6NHT5 357 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 L7N2F9 121 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 MANBAO00462 879 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 BCKDHAP12694 445 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 DNASE1P24855 282 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 PSEN2P49810 448 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 CCL15Q16663 113 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 KLHL22Q53GT1 634 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 HYLS1Q96M11 299 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 SLITRK2Q9H156 845 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ALDH1A1P00352 501 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 PRSS56P0CW18 603 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 PFKLP17858 780 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ACSL1P33121 698 aa14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 FCGRTP55899 365 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms