RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 C1orf109Q9NX04 203 aa21.78■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 KLHL20Q9Y2M5 609 aa21.78■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.78■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 NRP2O60462 931 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 UBXN7O94888 489 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 GRIA3P42263 894 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 PIK3CBP42338 1070 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 ATP4BP51164 291 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 RPS13P62277 151 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 BNIP1Q12981 228 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 SPESP1Q6UW49 350 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 TRIM73Q86UV7 250 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 ZFAND4Q86XD8 727 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 278.5
UFD1-201ENST00000263202 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 OR2I1PQ8NGU4 316 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 C1orf50Q9BV19 199 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 DMRT3Q9NQL9 472 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 SNX7Q9UNH6 387 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.77■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa21.77■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 TRBC2A0A5B9 178 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 SEC22BO75396 215 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 ETHE1O95571 254 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 CER1O95813 267 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 SYPP08247 313 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 CCT8P50990 548 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 DIO3P55073 304 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 RPL38P63173 70 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 SQLEQ14534 574 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 KIAA0040Q15053 153 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 CCDC6Q16204 474 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 GSTA3Q16772 222 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 CMTM7Q96FZ5 175 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 DUSP23Q9BVJ7 150 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 MRGBPQ9NV56 204 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 AIG1Q9NVV5 245 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 LRIT1Q9P2V4 623 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 VPS29Q9UBQ0 182 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 HAT1O14929 419 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 SLC22A2O15244 555 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 TNFSF14O43557 240 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 OR1F1O43749 312 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 KIAA0754O94854 1291 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 CBX6O95503 412 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 T-ENOLP0DO92 83 aa21.76■■□□□ 1.07
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UFD1-201ENST00000263202 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 KLHL35Q6PF15 583 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 PAQR7Q86WK9 346 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 PLD3Q8IV08 490 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 GPR45Q9Y5Y3 372 aa21.76■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 TRIM38O00635 465 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 FKBP9O95302 570 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 IDO1P14902 403 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 AMD1P17707 334 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 GRK3P35626 688 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 SCTRP47872 440 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 PPP1CAP62136 330 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 PHEXP78562 749 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 OR4C6Q8NH72 309 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 APIPQ96GX9 242 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 SARGQ9BW04 601 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 RAB23Q9ULC3 237 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 PPT2Q9UMR5 302 aa21.75■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 TGFB1P01137 390 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 PROS1P07225 676 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 ALPPL2P10696 532 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 CD1EP15812 388 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 GLB1P16278 677 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 MAGP20916 626 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 GPX3P22352 226 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 PIK3R1P27986 724 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 LSSP48449 732 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 EPHA4P54764 986 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 STX1BP61266 288 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 NAA25Q14CX7 972 aa21.74■■□□□ 1.07
UFD1-201ENST00000263202 IL23RQ5VWK5 629 aa21.74■■□□□ 1.07
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