RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 SEPHS1P49903 392 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 UFM1P61960 85 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 STEAP4Q687X5 459 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 OR10H4Q8NGA5 316 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 IRF7Q92985 503 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRS-201ENST00000262963 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 COCHO43405 550 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 GJB5O95377 273 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 C8BP07358 591 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 SLC35E2BP0CK96 405 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 G6PDP11413 515 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 CCKBRP32239 447 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 GGT5P36269 586 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF678Q5SXM1 525 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 AKAP14Q86UN6 197 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 HTRA1Q92743 480 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 UFD1Q92890 307 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 CD244Q9BZW8 370 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 A0A0J9YVX5 310 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 REM1O75628 298 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 PGLSO95336 258 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF823P16415 610 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 KCNC3Q14003 757 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 PJA1Q8NG27 643 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 MKS1Q9NXB0 559 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 M0QX08 132 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 TNFP01375 233 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 MAGP20916 626 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 BDKRB1P46663 353 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 DNASE1L1P49184 302 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 AP3S2P59780 193 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 IRF5Q13568 498 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 SPANXN4Q5MJ08 99 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 EOGTQ5NDL2 527 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 POF1BQ8WVV4 589 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 KCNA7Q96RP8 456 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 CLEC4AQ9UMR7 237 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 TRBC2A0A5B9 178 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 AREL1O15033 823 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 SNX4O95219 450 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 HOXB2P14652 356 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 DMPKQ09013 629 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 CEP97Q8IW35 865 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 PMEPA1Q969W9 287 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 TMBIM1Q969X1 311 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 MTMR10Q9NXD2 777 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 MYO7AQ13402 2215 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 ETV4P43268 484 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 ATP4BP51164 291 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 XKP51811 444 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 CREB5Q02930 508 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 GANABQ14697 944 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 PHF12Q96QT6 1004 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF382Q96SR6 550 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 DAPL1A0PJW8 107 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFS4O43181 175 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 GRID2O43424 1007 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 GMFGO60234 142 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 FPR1P21462 350 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 KCNA5P22460 613 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 CASP9P55211 416 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 TAS2R50P59544 299 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 MVKQ03426 396 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 MXD1Q05195 221 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRS-201ENST00000262963 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms