RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 FAM129CQ86XR2 697 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 NRROSQ86YC3 692 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB18Q99592 522 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 CLMPQ9H6B4 373 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 A0A1W2PPC4 97 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 NME4O00746 187 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 AXIN1O15169 862 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 MAP3K13O43283 966 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF217O75362 1048 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 THEGLP0DJG4 465 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SLC6A2P23975 617 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 REPS1Q96D71 796 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SLC6A18Q96N87 628 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 OR51B5Q9H339 312 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 GID8Q9NWU2 228 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.34■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 FEZF1A0PJY2 475 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM38O00635 465 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PRPS2P11908 318 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PKLRP30613 574 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SESN3P58005 492 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 RABL3Q5HYI8 236 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 CDC26Q8NHZ8 85 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 CMTM6Q9NX76 183 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 PPT2Q9UMR5 302 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 MUC3AQ02505 3323 aa20.33■□□□□ 0.85
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF839A8K0R7 811 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 AKAP10O43572 662 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 B3GALT4O96024 378 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 HSD3B1P14060 373 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 HSD3B2P26439 372 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 CLDN8P56748 225 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 RAE1P78406 368 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 MTAPQ13126 283 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 FLOT2Q14254 428 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 GPR153Q6NV75 609 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 CD300AQ9UGN4 299 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 DMTF1Q9Y222 760 aa20.33■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 PGRP06401 933 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 MAPK1P28482 360 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 PHC1P78364 1004 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 OR2A1Q8NGT9 310 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 FCRL1Q96LA6 429 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM74Q96NL1 305 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 NELL2Q99435 816 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 MAOBP27338 520 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 CYP4F2P78329 520 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 LAPTM5Q13571 262 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 SYT12Q8IV01 421 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 PLD3Q8IV08 490 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 PATE1Q8WXA2 126 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.32■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 A6NCN8 305 aa20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 ACOT8O14734 319 aa20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 GBAP04062 536 aa20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 SLC19A1P41440 591 aa20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 FZD2Q14332 565 aa20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD53Q8N9V6 530 aa20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RFXAP-201ENST00000255476 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms