RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253024.9

TRIM28-201, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM28, Length 2,960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM28-201ENST00000253024 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
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TRIM28-201ENST00000253024 DNASE1L2Q92874 299 aa20.58■□□□□ 0.89
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TRIM28-201ENST00000253024 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
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TRIM28-201ENST00000253024 BCAP31P51572 246 aa20.58■□□□□ 0.88
TRIM28-201ENST00000253024 CDH12P55289 794 aa20.58■□□□□ 0.88
TRIM28-201ENST00000253024 NTHL1P78549 312 aa20.58■□□□□ 0.88
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