RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 HRH2P25021 359 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS21Q2M5E4 152 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKDD1AQ495B1 522 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 GLYATQ6IB77 296 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 DPPA4Q7L190 304 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT13Q8IUC8 556 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS33AQ96AX1 596 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL7BQ9BQE9 202 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT2B28Q9BY64 529 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIL1Q9Y3C6 166 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 POM121BA6NF01 834 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51F1A6NGY5 319 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD66B4E2M5 251 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP99D6REC4 459 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 BCAP31P51572 246 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 CSRP2Q16527 193 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC23A3Q6PIS1 610 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 FRA10AC1Q70Z53 315 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPSQ8N2Z9 138 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM145Q8NBT3 493 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 RMDN1Q96DB5 314 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC115Q96NT0 180 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 FANCEQ9HB96 536 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ERGIC3Q9Y282 383 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR37Q9Y2I8 494 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 NCK1P16333 377 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CRTC1Q6UUV9 634 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 XKR5Q6UX68 686 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR23CQ6ZRP0 262 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC30BQ8N4P2 665 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 AP3M1Q9Y2T2 418 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH15Q96QU1 1955 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM131Q92545 1883 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC14BA6NHZ5 514 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA6P08133 673 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 GNSP15586 552 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 MATN1P21941 496 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 RACK1P63244 317 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 SGCGQ13326 291 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR8J3Q8NGG0 315 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 GIN1Q9NXP7 522 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 VIPR1P32241 457 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 GCNT7Q6ZNI0 430 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 EID2BQ96D98 161 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SEPHS2Q99611 448 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD21L1Q9H4I0 556 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 USE1Q9NZ43 259 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PCTPQ9UKL6 214 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD3Q9Y597 815 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 NR1D2Q14995 579 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKN3Q16667 212 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 XAF1Q6GPH4 301 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SYVN1Q86TM6 617 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 MINDY2Q8NBR6 621 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52E4Q8NGH9 312 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF382Q96SR6 550 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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