RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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RNF170-201ENST00000240159 PPT2Q9UMR5 302 aa21.81■■□□□ 1.08
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RNF170-201ENST00000240159 OR2A1Q8NGT9 310 aa21.79■■□□□ 1.08
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RNF170-201ENST00000240159 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.79■■□□□ 1.08
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RNF170-201ENST00000240159 AKAP10O43572 662 aa21.77■■□□□ 1.08
RNF170-201ENST00000240159 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RNF170-201ENST00000240159 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RNF170-201ENST00000240159 THEGLP0DJG4 465 aa21.77■■□□□ 1.08
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RNF170-201ENST00000240159 H3BNX3 289 aa21.77■■□□□ 1.07
RNF170-201ENST00000240159 SAP18O00422 153 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
RNF170-201ENST00000240159 BAG2O95816 211 aa21.77■■□□□ 1.07
RNF170-201ENST00000240159 C21orf58P58505 322 aa21.77■■□□□ 1.07
RNF170-201ENST00000240159 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.077e-6■■■■□ 19.9
RNF170-201ENST00000240159 PGS1Q32NB8 556 aa21.77■■□□□ 1.07
RNF170-201ENST00000240159 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.77■■□□□ 1.07
RNF170-201ENST00000240159 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
RNF170-201ENST00000240159 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
RNF170-201ENST00000240159 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
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