RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 SCN2AQ99250 2005 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 OR1F1O43749 312 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 PRAMEF12O95522 483 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 PROZP22891 400 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 NFATC3Q12968 1075 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 GMFGO60234 142 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 MMP3P08254 477 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 BEX1Q9HBH7 125 aa9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SLC3A1Q07837 685 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 EIPR1Q53HC9 387 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SNX20Q7Z614 316 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SYVN1Q86TM6 617 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 FBXO27Q8NI29 283 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 MAGEH1Q9H213 219 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 FUOMA2VDF0 154 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 G6PDP11413 515 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CD93Q9NPY3 652 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ST3GAL4Q11206 333 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 KCNAB2Q13303 367 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ANKFN1Q8N957 763 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 OR2L3Q8NG85 312 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CTSEP14091 401 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ATP4BP51164 291 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CD84Q9UIB8 345 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 DNAJB5O75953 348 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 STBD1O95210 358 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 OR5AK3PQ8NH89 298 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CERKQ8TCT0 537 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 MEMO1Q9Y316 297 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 PPEF2O14830 753 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 TCEAL1Q15170 157 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 KXD1Q9BQD3 176 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ASPNQ9BXN1 380 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 HPRP00739 348 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 NANOGQ9H9S0 305 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CALML5Q9NZT1 146 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 RAB36O95755 333 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ITPKBP27987 946 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CES5AQ6NT32 575 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 C2orf74A8MZ97 194 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 GSTT2P0CG29 244 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ZNF627Q7L945 461 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SOX14O95416 240 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 NCSTNQ92542 709 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 CDC7O00311 574 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 HK1P19367 917 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 GABARAPL2P60520 117 aa9.92□□□□□ -0.82
TTL-201ENST00000233336 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms