RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000044462.11

PSMA4-201, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMA4, Length 4,411 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-201ENST00000044462 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 AASSQ9UDR5 926 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 RAB26Q9ULW5 256 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 SQORQ9Y6N5 450 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 EFCAB10A6NFE3 127 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 H3BNC9 293 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 FFAR3O14843 346 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 GPR42O15529 346 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 LAMTOR5O43504 91 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 XPNPEP2O43895 674 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 GSRP00390 522 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 OAS1P00973 400 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 DCNP07585 359 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 FHP07954 510 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 CTSAP10619 480 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ELK4P28324 431 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 NRLP54845 237 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 GDF10P55107 478 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 TP53BP2Q13625 1128 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 PPA1Q15181 289 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 MAPRE2Q15555 327 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 SLC6A19Q695T7 634 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 PIGZQ86VD9 579 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 GHDCQ8N2G8 530 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 IPMKQ8NFU5 416 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 SLC25A36Q96CQ1 311 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 RTP4Q96DX8 246 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 PCED1BQ96HM7 432 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 C5orf34Q96MH7 638 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 BIRC8Q96P09 236 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ALG2Q9H553 416 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 DEC1Q9P2X7 70 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 MBD2Q9UBB5 411 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 MID2Q9UJV3 735 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ALG5Q9Y673 324 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 LAMA5O15230 3695 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 WRBO00258 174 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ZNF623O75123 536 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 LRCH4O75427 683 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 TGM6O95932 706 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ADH1CP00326 375 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 CKMT1AP12532 417 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 PTAFRP25105 342 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 PREPP48147 710 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 MEOX2P50222 304 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ADGRE1Q14246 886 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 PYDC2Q56P42 97 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 TRIQKQ629K1 86 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 LACC1Q8IV20 430 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 SCML4Q8N228 414 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 KYQ8NBH2 561 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 NETO2Q8NC67 525 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 OR2T34Q8NGX1 318 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ACDQ96AP0 544 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 FBXO44Q9H4M3 255 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ING4Q9UNL4 249 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 DERAQ9Y315 318 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.89□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 POP7O75817 140 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 NUDT17P0C025 328 aa4.88□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ETS1P14921 441 aa4.88□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PSMA4-201ENST00000044462 NAGAP17050 411 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms