RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 AurkcO88445 282 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 VimP20152 466 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CtskP55097 329 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 AbatP61922 500 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Irx2P81066 474 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Polr2cP97760 275 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slc45a4Q0P5V9 785 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slc30a10Q3UVU3 470 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 RflnbQ5SVD0 216 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ift52Q62559 426 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dusp23Q6NT99 150 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kif26bQ7TNC6 2112 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 RflnaQ7TS73 204 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zfp101Q8BP18 612 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Banf2Q8BVR0 90 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Znf451Q8C0P7 1056 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tlk1Q8C0V0 766 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sertm1Q8CD78 107 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dync1li1Q8R1Q8 523 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Osgin1Q8VC10 478 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Noxo1Q8VCM2 349 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trim8Q99PJ2 551 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm16286Q9CQX6 220 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fgfr1op2Q9CRA9 253 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Poc5Q9DBS8 558 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CrotQ9DC50 612 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Clca3a2Q9EQR4 902 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vnn3Q9QZ25 500 aa13.21□□□□□ -0.29
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm21885A0A286YDN8 145 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 1700023F06RikA2AB62 382 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam217bA2AJW5 387 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zfp808B8JJZ4 753 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm4871D3Z0W7 314 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm28043E0CXC2 719 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cyp2d37-psF6YKB5 150 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm6351K9J7D1 481 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm20878L7N244 103 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 GnazO70443 355 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 P01657 111 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Htr5bP31387 370 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rab23P35288 237 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lrriq3Q14DL3 633 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 OtulinQ3UCV8 352 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pacs2Q3V3Q7 862 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr381Q5SSP0 311 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 HjurpQ6PG16 667 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kyat3Q71RI9 455 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 RragdQ7TT45 449 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sdhaf3Q8BQU3 125 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Wdr60Q8C761 999 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ahi1Q8K3E5 1047 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Q91W34 466 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Chil4Q91Z98 402 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 BniplQ99JU7 328 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nudt21Q9CQF3 227 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 AasdhpptQ9CQF6 309 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Chit1Q9D7Q1 464 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cdrt4Q9DA64 179 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pop7Q9DCH2 140 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Il22Q9JJY9 179 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Katna1Q9WV86 491 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ascc3E9PZJ8 2198 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tox2A2A472 547 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr220E9Q050 325 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rnf165E9QAU8 347 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm6619F6URP1 175 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vmn2r3H3BJ88 915 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vmn2r6H3BK29 913 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm11168J3QN50 228 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Phox2bO35690 314 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lgals7O54974 136 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 IkbkgO88522 412 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cntn1P12960 1020 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lrrc3P59034 257 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ptpn2Q06180 406 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ica1lQ3TY65 431 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kdm4dQ3U2K5 510 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm5800Q497L3 186 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Q5SPV6 233 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Xrcc1Q60596 631 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Jak3Q62137 1100 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cpsf6Q6NVF9 551 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dusp16Q6PCP3 660 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr1134Q7TR43 312 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ntf4Q80VU4 209 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rnf38Q8BI21 518 aa13.2□□□□□ -0.3
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tspan12Q8BKT6 305 aa13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.9 ms