RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SUSD2Q9UGT4 822 aa23.95■■□□□ 1.43
CAPNS1-215ENST00000628018 DOLKQ9UPQ8 538 aa23.95■■□□□ 1.43
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CAPNS1-215ENST00000628018 KRT34O76011 436 aa23.94■■□□□ 1.42
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CAPNS1-215ENST00000628018 PARP9Q8IXQ6 854 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB44Q8NCP5 570 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R1Q9NYW7 299 aa23.91■■□□□ 1.42
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