RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 RIC8BQ9NVN3 520 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 SOX13Q9UN79 622 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 HEXBP07686 556 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 CELA2AP08217 269 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 PKMP14618 531 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 HSD17B2P37059 387 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 CDK16Q00536 496 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 RELAQ04206 551 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 RPS6KA1Q15418 735 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 ICE2Q659A1 982 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 FAAH2Q6GMR7 532 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 MYO7BQ6PIF6 2116 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 PKP4Q99569 1192 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF700Q9H0M5 742 aa23.67■■□□□ 1.38
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PTPRF-216ENST00000617451 TAC3Q9UHF0 121 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP10A1A4S6 786 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 FOXS1O43638 330 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 WFS1O76024 890 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 CATP04040 527 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 ANXA5P08758 320 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 PRF1P14222 555 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 EZRP15311 586 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 PNLIPRP1P54315 467 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 KCNK10P57789 538 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 DRC3Q9H069 523 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 CCNDBP1O95273 360 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 SLC16A8O95907 504 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 TPSB2P20231 275 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 OGNP20774 298 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 PCOLCEQ15113 449 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 TPSAB1Q15661 275 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM205Q6UW68 189 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 CENPUQ71F23 418 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 RNF32Q9H0A6 362 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRF-216ENST00000617451 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.386e-7■■■□□ 17.6
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PTPRF-216ENST00000617451 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 E5RI56 91 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 E7ENX8 843 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 I3L1I5 382 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TXNDC9O14530 226 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 WDPCPO95876 746 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 F10P00742 488 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ1P48048 391 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 EFNA3P52797 238 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 TAP2Q03519 686 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 FAM53BQ14153 422 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ11Q14654 390 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SYT16Q17RD7 645 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 NEK10Q6ZWH5 1172 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF480Q8WV37 535 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 MKL2Q9ULH7 1088 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 OTOGQ6ZRI0 2925 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 P2RX6O15547 441 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 AP2B1P63010 937 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 AMER2Q8N7J2 671 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 IMMP1LQ96LU5 166 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SLC30A3Q99726 388 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRF-216ENST00000617451 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 AVILO75366 819 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ARMC3Q5W041 872 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 SPC24Q8NBT2 197 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 ASB11Q8WXH4 323 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRF-216ENST00000617451 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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