RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	USP1	O94782	785 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	SLC16A8	O95907	504 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	STATH	P02808	62 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ESR1	P03372	595 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	TUBB4A	P04350	444 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	NPY2R	P49146	381 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	TNFSF10	P50591	281 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	TDGF1P3	P51864	188 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	KCNK10	P57789	538 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ARG2	P78540	354 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	CUL1	Q13616	776 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	CENPU	Q71F23	418 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	FJX1	Q86VR8	437 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	BCORP1	Q8N888	145 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	OR2A5	Q96R48	311 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PKP4	Q99569	1192 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	FBN2	P35556	2912 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	HAT1	O14929	419 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	FGG	P02679	453 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	SERPINA7	P05543	415 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	STS	P08842	583 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	TPSB2	P20231	275 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	CHRM3	P20309	590 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	SLC26A3	P40879	764 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MAGEA6	P43360	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	VPS41	P49754	854 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	CLCN7	P51798	805 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PNLIPRP1	P54315	467 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	EMP2	P54851	167 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	EMP3	P54852	163 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ICE2	Q659A1	982 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MVB12A	Q96EY5	273 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	VPS50	Q96JG6	964 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422		E7ENX8	843 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422		H3BMM5	538 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PCDH17	O14917	1159 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PHF2	O75151	1096 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	VPS26A	O75436	327 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	JRK	O75564	520 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	WDPCP	O95876	746 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ITGAM	P11215	1152 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	CASQ1	P31415	396 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PER3	P56645	1201 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	TAP2	Q03519	686 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.48	□□□□□ -0.57

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