RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	FDXR	P22570	491 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	CD97	P48960	835 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PGGT1B	P53609	377 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	TBPL1	P62380	186 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PHKG1	Q16816	387 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	HKDC1	Q2TB90	917 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	HPS6	Q86YV9	775 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT16	Q8N428	558 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	LINGO1	Q96FE5	620 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PLAA	Q9Y263	795 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	VWA7	Q9Y334	891 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200		H7BY64	318 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	HAT1	O14929	419 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	RAPSN	Q13702	412 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	MYBPC3	Q14896	1274 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	COL26A1	Q96A83	441 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	MVB12A	Q96EY5	273 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	CABS1	Q96KC9	395 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	OLFM1	Q99784	485 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	C5AR2	Q9P296	337 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX24	Q9Y343	169 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PSAT1	Q9Y617	370 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		20.74	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	IL2	P60568	153 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PLD3	Q8IV08	490 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	GPATCH11	Q8N954	259 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC23	Q9UJX2	597 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	20.73	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RX6	O15547	441 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	DPM1	O60762	260 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	HRH2	P25021	359 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	KLC1	Q07866	573 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	DSG2	Q14126	1118 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PALM2	Q8IXS6	379 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8NA96	180 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SGPP1	Q9BX95	441 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNDC9	O14530	226 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXS1	O43638	330 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC26A3	P40879	764 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	MGAT5	Q09328	741 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	VWA2	Q5GFL6	755 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCK2	Q7Z695	626 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	AMER3	Q8N944	861 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ERP44	Q9BS26	406 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFAT	Q9P243	1243 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	20.71	■□□□□ 0.91

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