RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SMAPO00193 183 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 LRRTM2O43300 516 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 CCNDBP1O95273 360 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 KRT14P02533 472 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 PRR35P0CG20 571 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 CXCR2P25025 360 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 SLC26A3P40879 764 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ARG2P78540 354 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TAP2Q03519 686 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 CTBP1Q13363 440 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 CUL1Q13616 776 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TTLL9Q3SXZ7 439 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ARMC3Q5W041 872 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 FAM180AQ6UWF9 173 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ADCK2Q7Z695 626 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TRIM58Q8NG06 486 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR1N1Q8NGS0 311 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 MED16Q9Y2X0 877 aa16.08■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQ72 361 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZNF839A8K0R7 811 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 P2RX6O15547 441 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 FOXS1O43638 330 aa16.07■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TTC27Q6P3X3 843 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 PLD3Q8IV08 490 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 SIRT6Q8N6T7 355 aa16.07■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.07■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 C14orf105Q9NVL8 296 aa16.07■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 MAGEB16A2A368 324 aa16.06■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 GFYI3L273 518 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TXNDC9O14530 226 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 HAT1O14929 419 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 SERPINA7P05543 415 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 MPC1LP0DKB6 136 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 MLNP12872 115 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 FDXRP22570 491 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 SOX11P35716 441 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ABATP80404 500 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 RELAQ04206 551 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 AMER2Q8N7J2 671 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 BCORP1Q8N888 145 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ASB11Q8WXH4 323 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 KCNJ9Q92806 393 aa16.06■□□□□ 0.16
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HERC3-211ENST00000513325 TGIF2Q9GZN2 237 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 OLAHQ9NV23 265 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 DHRS7Q9Y394 339 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 CACNA1DQ01668 2161 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 H7BY64 318 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB14O43829 449 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 KIF5CO60282 957 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 WFS1O76024 890 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 BMP10O95393 424 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 F10P00742 488 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 STATHP02808 62 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 TNFSF10P50591 281 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 PER3P56645 1201 aa16.05■□□□□ 0.16
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