RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510173.6

RBM4-208, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

TSL 3

Gene RBM4, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-208	ENST00000510173	CRADD	P78560	199 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	TRADD	Q15628	312 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MCU	Q8NE86	351 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	NFS1	Q9Y697	457 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ERG	P11308	486 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MLN	P12872	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MGAT1	P26572	445 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	PSMB5	P28074	263 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	FMO4	P31512	558 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	KLC1	Q07866	573 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CDC16	Q13042	620 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	DSG2	Q14126	1118 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	GBX1	Q14549	363 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	INPP5D	Q92835	1189 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MFSD3	Q96ES6	412 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	LMF1	Q96S06	567 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	SYBU	Q9NX95	663 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	C3orf18	Q9UK00	162 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	PCM1	Q15154	2024 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173		A0A1W2PPV9	198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	DYTN	A2CJ06	578 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MYO1C	O00159	1063 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ANXA5	P08758	320 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	EDN3	P14138	238 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ARNT	P27540	789 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ABAT	P80404	500 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MFAP5	Q13361	173 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	INA	Q16352	499 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	HIF1A	Q16665	826 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CENPU	Q71F23	418 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MAGEB16	A2A368	324 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	MASP2	O00187	686 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM4-208	ENST00000510173	ALOX12B	O75342	701 aa		13.61	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms