RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PP55 124 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PQF6 199 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 C7orf72A4D263 438 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL33A6NCF5 533 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEB17A8MXT2 336 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 KMOO15229 486 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PI15O43692 258 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDH8O95206 1070 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 FUCA1P04066 466 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 LYNP07948 512 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PRPS1L1P21108 318 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 KELP23276 732 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 NTSR1P30989 418 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TRPC1P48995 793 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MTPNP58546 118 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKCQQ04759 706 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP4F3Q08477 520 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 DMPKQ09013 629 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MED21Q13503 144 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP19Q14CB8 494 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 IRF4Q15306 451 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP2A13Q16696 494 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 UGT8Q16880 541 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 GTDC1Q4AE62 458 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TBCELQ5QJ74 424 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CATSPEREQ5SY80 951 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ADNP2Q6IQ32 1131 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MED27Q6P2C8 311 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 NXPE4Q6UWF7 544 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 LCTLQ6UWM7 567 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SYTL1Q8IYJ3 562 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 FLCNQ8NFG4 579 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 HUS1BQ8NHY5 278 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ASB12Q8WXK4 309 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RAD51AP1Q96B01 352 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ITCHQ96J02 903 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF597Q96LX8 424 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 NECTIN4Q96NY8 510 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC29A1Q99808 456 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 INPP5KQ9BT40 448 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MENTQ9BUN1 341 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 EFCAB11Q9BUY7 163 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 OSBPL6Q9BZF3 934 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 GORASP2Q9H8Y8 452 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 FBRSQ9HAH7 460 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TRPV5Q9NQA5 729 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC6A13Q9NSD5 602 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAM23O75077 832 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL18O94889 574 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 ANXA6P08133 673 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 OXTRP30559 389 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CTHP32929 405 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 HSD17B2P37059 387 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 HSPA13P48723 471 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CLCN2P51788 898 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC13P55735 322 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS21P63220 83 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PLIN5Q00G26 463 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 LAPTM5Q13571 262 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 MTX3Q5HYI7 312 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52E8Q6IFG1 317 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM154Q6P9G4 183 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 DOK6Q6PKX4 331 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 UGT2A3Q6UWM9 527 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMKMTQ7Z624 323 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRED1Q7Z699 444 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 UBALD2Q8IYN6 164 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D21Q8IYX1 336 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PACRGLQ8N7B6 248 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM105Q8N8V8 129 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 IL17RCQ8NAC3 791 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PHC3Q8NDX5 983 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 OR8J2Q8NGG1 315 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5AR1Q8NGP9 310 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC5A11Q8WWX8 675 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP2-209ENST00000504450 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms