RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CERS4Q9HA82 394 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SGK2Q9HBY8 427 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TDP1Q9NUW8 608 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 B3GALT4O96024 378 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GSNP06396 782 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GP1BAP07359 652 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ANXA5P08758 320 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 MSL3P1P0C860 447 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SMIM18P0DKX4 95 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FASP25445 335 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ETV3P41162 512 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EMX2Q04743 252 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GTDC1Q4AE62 458 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ARSIQ5FYB1 569 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TMEM215Q68D42 235 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD46Q86W74 232 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DPY30Q9C005 99 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TRIM15Q9C019 465 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PDE10AQ9Y233 779 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FUOMA2VDF0 154 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LATO43561 262 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HRO43593 1189 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LEFTY1O75610 366 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 WDR47O94967 919 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LRATO95237 230 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ADH1CP00326 375 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TFAP2AP05549 437 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GNAO1P09471 354 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OR56A5P0C7T3 313 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SPINT3P49223 89 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EMP3P54852 163 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 BNIP2Q12982 314 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GRM2Q14416 872 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TSSK3Q96PN8 268 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EHD1Q9H4M9 534 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 VAPAQ9P0L0 249 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 AQP12BA6NM10 295 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 MANBAO00462 879 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RGS14O43566 566 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN9O75954 239 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TNFAIP8O95379 198 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H2ADP20671 130 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GNPDA1P46926 289 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 STT3AP46977 705 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ENTPD1P49961 510 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CDH15P55291 814 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ABRQ12979 859 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 E2F2Q14209 437 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GLYATQ6IB77 296 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LCN8Q6JVE9 175 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.79□□□□□ -1.32
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