RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 GRAP2O75791 330 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM16O95361 564 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MOCS3O95396 460 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CBX6O95503 412 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 DDAH2O95865 285 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 IL1BP01584 269 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 APOEP02649 317 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PAEPP09466 180 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CKMT1AP12532 417 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PDGFRAP16234 1089 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF18P17022 549 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CD27P26842 260 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ARRB2P32121 409 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 HNF1BP35680 557 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CSKP41240 450 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MAPK9P45984 424 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MTNR1AP48039 350 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 FMO5P49326 533 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 BNC1Q01954 994 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 LRRC63Q05C16 580 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 NME3Q13232 169 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 BECN1Q14457 450 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 IL13RA2Q14627 380 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 E2F5Q15329 346 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CST6Q15828 149 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CAMK4Q16566 473 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 NFIL3Q16649 462 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 COL28A1Q2UY09 1125 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 DCAF6Q58WW2 860 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 FSCBQ5H9T9 825 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB41Q5JT25 222 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 NADSYN1Q6IA69 706 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TAC4Q86UU9 113 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 GPSM1Q86YR5 675 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 UNC45BQ8IWX7 931 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 APCDD1Q8J025 514 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 STK40Q8N2I9 435 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CPXM2Q8N436 756 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 EID2Q8N6I1 236 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 INPP5DQ92835 1189 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 BIRC7Q96CA5 298 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 RNFT2Q96EX2 444 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SERAC1Q96JX3 654 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SERPINB11Q96P15 392 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 GSDMAQ96QA5 445 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CD180Q99467 661 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC2A11Q9BYW1 496 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 NEUROG2Q9H2A3 272 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM245Q9H330 911 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SYNCQ9H7C4 482 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TM9SF3Q9HD45 589 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SUN2Q9UH99 717 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 KIAA1257Q9ULG3 409 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ICKQ9UPZ9 632 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 MYO10Q9HD67 2058 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ITIH6Q6UXX5 1313 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SDK1Q7Z5N4 2213 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 BICDL2A1A5D9 508 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 LRRC72A6NJI9 287 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-211ENST00000492895 F5H5T6 163 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms