RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-217ENST00000490566 WDR34Q96EX3 536 aa10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 APOLD1Q96LR9 279 aa10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SGPP1Q9BX95 441 aa10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 OR52A5Q9H2C5 316 aa10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 VAPAQ9P0L0 249 aa10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SERGEFQ9UGK8 458 aa10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 PPT2Q9UMR5 302 aa10.02□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 A0A096LPI6 279 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 A6NHS1 94 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 H0YJX3 145 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 NCK1P16333 377 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 OXTRP30559 389 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 HSPA13P48723 471 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 PHC1P78364 1004 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 CDK3Q00526 305 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 FOLH1Q04609 750 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 CYP4F3Q08477 520 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 RPA4Q13156 261 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 LAPTM4AQ15012 233 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 RUNDC3AQ59EK9 446 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 DOK6Q6PKX4 331 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 LRRTM4Q86VH4 590 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 PROSER1Q86XN7 944 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 HDDC3Q8N4P3 179 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 RIPOR3Q96MK2 946 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 CCDC115Q96NT0 180 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 TSSK3Q96PN8 268 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 GDF15Q99988 308 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 VCXQ9H320 206 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 BRF2Q9HAW0 419 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SGK2Q9HBY8 427 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SERHLQ9NQF3 203 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 ITM2CQ9NQX7 267 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 RAB26Q9ULW5 256 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SH2B3Q9UQQ2 575 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 A0A1W2PP55 124 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 K7EQS6 105 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 DENRO43583 198 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 LYNP07948 512 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 UMPSP11172 480 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 IL10P22301 178 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 S100A3P33764 101 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 MTHFRP42898 656 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 GALK1P51570 392 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 C21orf58P58505 322 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 PLIN5Q00G26 463 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 MTAPQ13126 283 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 MED21Q13503 144 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 STARD3Q14849 445 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 IRF4Q15306 451 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 TMEM154Q6P9G4 183 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 MTSS1LQ765P7 747 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 TMPRSS11BQ86T26 416 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 SYTL1Q8IYJ3 562 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 MARVELD2Q8N4S9 558 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 NEIL2Q969S2 332 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 FAM131CQ96AQ9 280 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 EME1Q96AY2 570 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 ITCHQ96J02 903 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 ZNF583Q96ND8 569 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 OR52E6Q96RD3 313 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 EBPLQ9BY08 206 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 TEX101Q9BY14 249 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 KCNH6Q9H252 994 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 NEUROD4Q9HD90 331 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-217ENST00000490566 VPS29Q9UBQ0 182 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms