RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DOCK2Q92608 1830 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2QL1A1L167 161 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLK3P49761 638 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDGFRLQ15198 375 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIGD6Q17RP2 521 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPTNQ6XPR3 784 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDT13Q86X67 352 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PPW3 197 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBC2A0A5B9 178 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf78A6NCI8 922 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTNP21246 168 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRISP3P54108 245 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFATC2Q13469 925 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRF5Q13568 498 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRRS1Q6ZNA5 592 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC80Q76M96 950 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHC3Q8NDX5 983 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR52B6Q8NGF0 335 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MBD2Q9UBB5 411 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMB1P07942 1786 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLOD5A6NK44 160 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DFNA5O60443 496 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDI1P31150 447 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK6Q00534 326 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EMX2Q04743 252 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR68Q15743 365 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTP2Q5QGT7 225 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK15Q8TD08 544 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRCH3Q96II8 777 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf74Q96LT6 269 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF623O75123 536 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGF18O76093 207 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOX14O95416 240 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FESP07332 822 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADH5P11766 374 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD1DP15813 335 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DSTNP60981 165 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC50Q53HI1 259 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEACAM20Q6UY09 585 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDCD10Q9BUL8 212 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHCGQ9UBD6 479 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMB2P55268 1798 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PITPNM1O00562 1244 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPN15O75808 1086 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CH25HO95992 272 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCR8P51685 355 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGSF21Q96ID5 467 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD244Q9BZW8 370 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCG4Q9H172 646 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INSL6Q9Y581 213 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALPPL2P10696 532 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC8B1Q6J4K2 584 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB8BQ92930 207 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHRS7Q9Y394 339 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F5P12259 2224 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF33A8MVX0 844 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EBLN1P0CF75 366 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VIPR1P32241 457 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR1E2P47887 323 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYVN1Q86TM6 617 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OAFQ86UD1 273 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT27Q9BW83 186 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LEFTY2O00292 366 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKT2P31751 481 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNF1BP35680 557 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABHD18Q0P651 414 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UAP1L1Q3KQV9 507 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EMC10Q5UCC4 262 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR6K6Q8NGW6 343 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFKBIDQ8NI38 313 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.8 ms