RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476543.1

AC108729.2-201, humanhuman

BASIC

Gene AC108729.2, Length 840 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC108729.2-201ENST00000476543 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 FBXO17Q96EF6 278 aa4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 C4orf45Q96LM5 186 aa4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 TUFT1Q9NNX1 390 aa4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.78□□□□□ -1.64
AC108729.2-201ENST00000476543 IGSF1Q8N6C5 1336 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 A0A0U1RQK1 487 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF320A2RRD8 509 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SERINC4A6NH21 518 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 EXTL3O43909 919 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SERPING1P05155 500 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 PRSS56P0CW18 603 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 PRKAR1AP10644 381 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 LHCGRP22888 699 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 IL10RBQ08334 325 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SGCGQ13326 291 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 P2RY6Q15077 328 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 E2F5Q15329 346 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 XKR6Q5GH73 641 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 LINC00696Q6ZRV3 163 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 KBTBD8Q8NFY9 601 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 TEKT1Q969V4 418 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 DUX3Q96PT4 197 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 R4GN57 208 aa4.77□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SDR42E2A6NKP2 422 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 C17orf105B2RV13 164 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 KBTBD13C9JR72 458 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 RAD51DO75771 328 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 NGFP01138 241 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 HMBSP08397 361 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 FAM157CP0CG43 387 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 CHRNB4P30926 498 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 NPBWR1P48145 328 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SLMAPQ14BN4 828 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 TAZQ16635 292 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 TTC27Q6P3X3 843 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 CYB5D1Q6P9G0 228 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 NUP93Q8N1F7 819 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 PRSS35Q8N3Z0 413 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 OR7G3Q8NG95 312 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 BTBD9Q96Q07 612 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 F2RL3Q96RI0 385 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 TMEM206Q9H813 350 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 TMEM161AQ9NX61 479 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 ILVBLA1L0T0 632 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SELENOFO60613 162 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 PRAF2O60831 178 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SOCS5O75159 536 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 TRMUO75648 421 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 AP2A2O94973 939 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 AMBPP02760 352 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 CFC1BP0CG36 223 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 CFC1P0CG37 223 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 CD27P26842 260 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 PSMB4P28070 264 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 IER3P46695 156 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 SQLEQ14534 574 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 MORF4L2Q15014 288 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 FUT11Q495W5 492 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF876PQ49A33 203 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF789Q5FWF6 425 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 FGD3Q5JSP0 725 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 ZNF790Q6PG37 636 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 IL17RELQ6ZVW7 336 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 GPR141Q7Z602 305 aa4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
AC108729.2-201ENST00000476543 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.1 ms