RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 AQP7O14520 342 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 SLC16A5O15375 505 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 RNF8O76064 485 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 RALBP11234 206 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 CD44P16070 742 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 FMO1Q01740 532 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 OGDHQ02218 1023 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 TRIM14Q14142 442 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 PCSK7Q16549 785 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 C8orf34Q49A92 452 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 RGS9BPQ6ZS82 235 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 AMER3Q8N944 861 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 NAXEQ8NCW5 288 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 C10orf90Q96M02 699 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 VN1R1Q9GZP7 353 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 ASB8Q9H765 288 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 PLAGL1Q9UM63 463 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 SPO11Q9Y5K1 396 aa12.48□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GVC2 190 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 FCHO1O14526 889 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 CYC1P08574 325 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 MAN2A2P49641 1150 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 PRLHRP49683 370 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 AGTR2P50052 363 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 TAP2Q03519 686 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 RPA4Q13156 261 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 SYT16Q17RD7 645 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 FRMPD2BQ6IN97 320 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 TRILQ7L0X0 811 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 OTOAQ7RTW8 1153 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 POLNQ7Z5Q5 900 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 BTLAQ7Z6A9 289 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 SLC22A16Q86VW1 577 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 TBC1D21Q8IYX1 336 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 TNIP2Q8NFZ5 429 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 SMARCE1Q969G3 411 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 LDAHQ9H6V9 325 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 NDRG3Q9UGV2 375 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 CTNND2Q9UQB3 1225 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 LIPGQ9Y5X9 500 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 DOCK7Q96N67 2140 aa12.47□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0J9YVX5 310 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 SOWAHDA6NJG2 315 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 SGTAO43765 313 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 CTSVO60911 334 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 IGHG3P01860 377 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 CHRNB2P17787 502 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 CCNCP24863 283 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 MIPP30301 263 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 SF1Q15637 639 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 ETFDHQ16134 617 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 ISM2Q6H9L7 571 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 ANKRD37Q7Z713 158 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 C3orf56Q8N813 242 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF398Q8TD17 642 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 ZUFSPQ96AP4 578 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 PIK3IP1Q96FE7 263 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 LPAR4Q99677 370 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 EXO5Q9H790 373 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 VPS37BQ9H9H4 285 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 DUSP10Q9Y6W6 482 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf3-211ENST00000463372 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 SUSD5O60279 629 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 IL2RAP01589 272 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 TUBB4AP04350 444 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 FREM3P0C091 2139 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 TPBGLP0DKB5 382 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 CREB1P16220 341 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 MLF1P58340 268 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 OCRLQ01968 901 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 DPYSL2Q16555 572 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 MIDNQ504T8 468 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 POMZP3Q6PJE2 187 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 SEM1Q6ZVN7 128 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 OR4N4Q8N0Y3 316 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 FATE1Q969F0 183 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 TRABDQ9H4I3 376 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf3-211ENST00000463372 PKP3Q9Y446 797 aa12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms