RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf226A1L170 272 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DPPA5A6NC42 116 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL33A6NCF5 533 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IGLON5A6NGN9 336 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C1QCP02747 245 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SEMG1P04279 462 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 APODP05090 189 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LINGO3P0C6S8 592 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 UMPSP11172 480 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GDI1P31150 447 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 BMP8BP34820 402 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IGFALSP35858 605 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GRIA3P42263 894 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CDKN2CP42773 168 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GPR1P46091 355 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SOX9P48436 509 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TRPC1P48995 793 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GALK1P51570 392 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MTPNP58546 118 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CTBSQ01459 385 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IRF8Q02556 426 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CYP4F3Q08477 520 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SLC14A1Q13336 389 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 APOFQ13790 326 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 NFE2L1Q14494 772 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IRF4Q15306 451 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6AP1Q15904 470 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MAP7D1Q3KQU3 841 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GTDC1Q4AE62 458 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SYTL3Q4VX76 610 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SGO1Q5FBB7 561 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 XKR6Q5GH73 641 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MTX3Q5HYI7 312 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RAET1GQ6H3X3 334 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LCTLQ6UWM7 567 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CARM1Q86X55 608 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FAM9CQ8IZT9 166 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 BIRC7Q96CA5 298 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 COQ8BQ96D53 544 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EGLN2Q96KS0 407 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PPM1MQ96MI6 270 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TIMM29Q9BSF4 260 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 INPP5KQ9BT40 448 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DPY30Q9C005 99 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM15Q9C019 465 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RHBGQ9H310 441 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ELOVL6Q9H5J4 265 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IGFLR1Q9H665 355 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF696Q9H7X3 374 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 COQ10BQ9H8M1 238 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FBRSQ9HAH7 460 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SLC28A3Q9HAS3 691 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1HQ9UI12 483 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MSRAQ9UJ68 235 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 AP3M1Q9Y2T2 418 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP10A1A4S6 786 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PIPSLA2A3N6 862 aa5.44□□□□□ -1.54
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