RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457749.6

ZNF28-204, Transcript of zinc finger protein 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF28, Length 4,556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28-204ENST00000457749 ALDH9A1P49189 494 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 VASPP50552 380 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PLA2G16P53816 162 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 GPR18Q14330 331 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 C16orf72Q14CZ0 275 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 RASA2Q15283 850 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CACHD1Q5VU97 1274 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 MCUR1Q96AQ8 359 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 C1orf50Q9BV19 199 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 P2RY12Q9H244 342 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 APMAPQ9HDC9 416 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PSD3Q9NYI0 1048 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 RNF11Q9Y3C5 154 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.56□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 C9JVG2 144 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PLD2O14939 933 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 YKT6O15498 198 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 B4GAT1O43505 415 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 DUX1O43812 170 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 UBOX5O94941 541 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ENO1P06733 434 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CBSLP0DN79 551 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 F3P13726 295 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CD9P21926 228 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CBSP35520 551 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 GGT5P36269 586 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 INHBCP55103 352 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 HERVK_113P63132 956 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 HMGCS1Q01581 520 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PCLAFQ15004 111 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SNCBQ16143 134 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 LRRC36Q1X8D7 754 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ISXQ2M1V0 245 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TECRLQ5HYJ1 363 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 KLHL35Q6PF15 583 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PIP4P1Q86T03 277 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 AMIGO1Q86WK6 493 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ASB11Q8WXH4 323 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ERP27Q96DN0 273 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CNDP1Q96KN2 507 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CATSPER2Q96P56 530 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 VPS35Q96QK1 796 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ERVK-6Q9BXR3 956 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TEX101Q9BY14 249 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TOR4AQ9NXH8 423 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SLC39A1Q9NY26 324 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 AKAP6Q13023 2319 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ZNF839A8K0R7 811 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 A8MUI8 341 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CLDN9O95484 217 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SOD1P00441 154 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 GBAP04062 536 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PROS1P07225 676 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PSMB5P28074 263 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ST13P50502 369 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PRKAA2P54646 552 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 AP1S2P56377 157 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 FOXL2P58012 376 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 LCP2Q13094 533 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CLCA4Q14CN2 919 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 C1orf189Q5VU69 101 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 MLIPQ5VWP3 458 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CLHC1Q8NHS4 586 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 RDH11Q8TC12 318 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SMPDL3AQ92484 453 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 RMI1Q9H9A7 625 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 GIMAP2Q9UG22 337 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 HAO1Q9UJM8 370 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 RAP2CQ9Y3L5 183 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms